2010年1月26日，國家稅務(wù)總局發(fā)布了《國家稅務(wù)總局關(guān)于建筑企業(yè)所得稅征管有關(guān)問題的通知》（國稅函[2010]39號）一文，文件按國稅發(fā)[2008]28號文精神，對跨地區(qū)（指跨省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市，下同）經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題做出了三項(xiàng)明確規(guī)定：

　　第一、實(shí)行總、分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計(jì)算、分級管理、就地預(yù)繳、匯總清算、財(cái)政調(diào)庫”的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　第二、建筑企業(yè)跨地區(qū)設(shè)立的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項(xiàng)目經(jīng)理部（包括與項(xiàng)目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應(yīng)匯總到總機(jī)構(gòu)或二級分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　第三、各地稅務(wù)機(jī)關(guān)自行制定的與本通知相抵觸的征管文件，一律停止執(zhí)行并予以糾正；對按照規(guī)定不應(yīng)就地預(yù)繳而征收了企業(yè)所得稅的，要及時(shí)將稅款返還給企業(yè)。未按本通知要求進(jìn)行糾正的，稅務(wù)總局將按照執(zhí)法責(zé)任制的有關(guān)規(guī)定嚴(yán)肅處理。

　　國稅函[2010]39號是企業(yè)所得稅法人稅制制度的重要體現(xiàn)，國家稅務(wù)總局面對地方各級稅務(wù)機(jī)關(guān)對建筑企業(yè)異地經(jīng)營稅源的爭奪，對建筑企業(yè)異地施工的所得稅征管體系作了上述規(guī)定，對跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)而言，值得稱贊。

　　但僅僅幾個月以后，2010年4月19日國家稅務(wù)總局又發(fā)布了《國家稅務(wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》（國稅函[2010]156號）文，對建筑企業(yè)異地施工的所得稅管理模式進(jìn)行了調(diào)整和補(bǔ)充。不少地方值得納稅人關(guān)注：

　　（一）堅(jiān)持法人所得稅制原則下，對征管方式作出調(diào)整。

　　第一，國稅函[2010]156號重申國稅函[2010]39號中關(guān)于實(shí)行總、分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)需要就地預(yù)繳企業(yè)所得稅的規(guī)定：

　　實(shí)行總分機(jī)構(gòu)體制的跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定，按照“統(tǒng)一計(jì)算，分級管理，就地預(yù)繳，匯總清算，財(cái)政調(diào)庫”的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　可見，企業(yè)所得稅法人稅制仍是建筑企業(yè)跨地區(qū)經(jīng)營企業(yè)所得稅征收管理所需遵循的基本精神。

　　第二，不就地預(yù)繳的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項(xiàng)目部范圍縮小。國稅函[2010]39號規(guī)定：建筑企業(yè)跨地區(qū)設(shè)立的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項(xiàng)目經(jīng)理部（包括與項(xiàng)目經(jīng)理部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等），應(yīng)匯總到總機(jī)構(gòu)或二級分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：建筑企業(yè)所屬二級或二級以下分支機(jī)構(gòu)直接管理的項(xiàng)目部（包括與項(xiàng)目部性質(zhì)相同的工程指揮部、合同段等，下同）不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額應(yīng)匯總到二級分支機(jī)構(gòu)統(tǒng)一核算，由二級分支機(jī)構(gòu)按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定的辦法預(yù)繳企業(yè)所得稅。

　　上述變化可以看到，總機(jī)構(gòu)直接管理的不符合二級分支機(jī)構(gòu)條件的項(xiàng)目部排除在不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅的范圍之外。

　　第三，規(guī)定了總機(jī)構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項(xiàng)目部預(yù)繳比例和方式。

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：建筑企業(yè)總機(jī)構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項(xiàng)目部，應(yīng)按項(xiàng)目實(shí)際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機(jī)構(gòu)向項(xiàng)目所在地預(yù)分企業(yè)所得稅，并由項(xiàng)目部向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)預(yù)繳。

　　例如，某建筑企業(yè)總公司設(shè)在北京，并在上海、杭州設(shè)有分公司（假設(shè)符合二級分支機(jī)構(gòu)的條件）。總機(jī)構(gòu)派出項(xiàng)目部在成都施工，上海分公司派出項(xiàng)目部在寧波施工，杭州分公司派出項(xiàng)目部在廣州施工。（假設(shè)成都、寧波、和廣州的項(xiàng)目部都不屬于二級分支機(jī)構(gòu)）

　　按國稅函[2010]39號規(guī)定，成都項(xiàng)目部的收入、費(fèi)用、資產(chǎn)應(yīng)納入總機(jī)構(gòu)統(tǒng)一計(jì)算，寧波項(xiàng)目部應(yīng)納入上海分公司統(tǒng)一計(jì)算，廣州項(xiàng)目經(jīng)理部應(yīng)納入杭州分公司統(tǒng)一計(jì)算，最后再按照國稅發(fā)[2008]28號文件進(jìn)行操作。因此，該企業(yè)雖然在成都、寧波、和廣州設(shè)立了項(xiàng)目部，但是并不需要就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。

　　但根據(jù)國稅函[2010]156號規(guī)定，成都項(xiàng)目部屬于總機(jī)構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的，應(yīng)按項(xiàng)目實(shí)際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機(jī)構(gòu)向項(xiàng)目所在地預(yù)分企業(yè)所得稅，并由項(xiàng)目部向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)預(yù)繳。

　　上述變化可以說是國家稅務(wù)總局，面對地方各級稅務(wù)機(jī)關(guān)稅源利益訴求，而作出妥協(xié)而產(chǎn)生的結(jié)果。但上述調(diào)整一方面堅(jiān)持了法人所得稅制的原則，另一方體現(xiàn)了稅源地利益要求。

　　（二）對總機(jī)構(gòu)應(yīng)匯總計(jì)算企業(yè)應(yīng)納所得稅的預(yù)繳方法作出明確

　　國稅函[2010]156號分三種情況，對總機(jī)構(gòu)應(yīng)匯總計(jì)算企業(yè)應(yīng)納所得稅的預(yù)繳方法作出了明確：

　　（1）總機(jī)構(gòu)只設(shè)跨地區(qū)項(xiàng)目部的，扣除已由項(xiàng)目部預(yù)繳的企業(yè)所得稅后，按照其余額就地納；

　　（2）總機(jī)構(gòu)只設(shè)二級分支機(jī)構(gòu)的，按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定計(jì)算總、分支機(jī)構(gòu)應(yīng)繳納的稅款；

　?。?）總機(jī)構(gòu)既有直接管理的跨地區(qū)項(xiàng)目部，又有跨地區(qū)二級分支機(jī)構(gòu)的，先扣除已由項(xiàng)目部預(yù)繳的企業(yè)所得稅后，再按照國稅發(fā)[2008]28號文件規(guī)定計(jì)算總、分支機(jī)構(gòu)應(yīng)繳納的稅款。

　　（三）重新強(qiáng)調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明

　　國稅函[2010]156號規(guī)定：跨地區(qū)經(jīng)營的項(xiàng)目部（包括二級以下分支機(jī)構(gòu)管理的項(xiàng)目部）應(yīng)向項(xiàng)目所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)出具總機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)開具的《外出經(jīng)營活動稅收管理證明》，未提供上述證明的，項(xiàng)目部所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)督促其限期補(bǔ)辦；不能提供上述證明的，應(yīng)作為獨(dú)立納稅人就地繳納企業(yè)所得稅。同時(shí)，項(xiàng)目部應(yīng)向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提供總機(jī)構(gòu)出具的證明該項(xiàng)目部屬于總機(jī)構(gòu)或二級分支機(jī)構(gòu)管理的證明文件。

　　國稅函[2010]39號出臺后，不少人認(rèn)為跨地區(qū)經(jīng)營的建筑企業(yè)所得稅的征收不再和外出經(jīng)營證明相掛鉤，無論是否開具外出經(jīng)營證明，都不存在建筑企業(yè)在施工項(xiàng)目所在地就地隨票附征企業(yè)所得稅的問題。但此次，國稅函[2010]156號重新強(qiáng)調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明，對上述觀點(diǎn)是當(dāng)頭一棒。

　　重新強(qiáng)調(diào)外出經(jīng)營活動稅收管理證明，建筑企業(yè)會擔(dān)心無法擺脫《國家稅務(wù)總局關(guān)于建筑安裝企業(yè)所得稅納稅地點(diǎn)問題的通知》（國稅發(fā)[1995]227號）下將企業(yè)所得稅管理與外出經(jīng)營證掛鉤，被重復(fù)征稅的厄運(yùn)。個別地方稅務(wù)機(jī)關(guān)必然會出于稅源利益保護(hù)的需要，緊緊抓住這個政策不放，對轄區(qū)內(nèi)的異地施工項(xiàng)目部征收企業(yè)所得稅。而項(xiàng)目部回到自己的總機(jī)構(gòu)所在地，總機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)為這部分稅款并不符合國稅發(fā)[2008]28號文件的規(guī)定，不允許其抵繳被征稅款。

　　此外，國稅函[2010]156號對明確建筑企業(yè)辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳主體、附送資料、適用范圍以及執(zhí)行時(shí)間作出了規(guī)定：

　　建筑企業(yè)總機(jī)構(gòu)應(yīng)按照有關(guān)規(guī)定辦理企業(yè)所得稅年度匯算清繳，各分支機(jī)構(gòu)和項(xiàng)目部不進(jìn)行匯算清繳?？倷C(jī)構(gòu)年終匯算清繳后應(yīng)納所得稅額小于已預(yù)繳的稅款時(shí)，由總機(jī)構(gòu)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理退稅或抵扣以后年度的應(yīng)繳企業(yè)所得稅。

　　建筑企業(yè)總機(jī)構(gòu)在辦理企業(yè)所得稅預(yù)繳和匯算清繳時(shí)，應(yīng)附送其所直接管理的跨地區(qū)經(jīng)營項(xiàng)目部就地預(yù)繳稅款的完稅證明。

　　建筑企業(yè)在同一省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市設(shè)立的跨地（市、縣）項(xiàng)目部，其企業(yè)所得稅的征收管理辦法，由各省、自治區(qū)、直轄市和計(jì)劃單列市國家稅務(wù)局、地方稅務(wù)局共同制定，并報(bào)國家稅務(wù)總局備案。

　　因此，建筑企業(yè)在統(tǒng)一省、自治區(qū)、直轄市或者計(jì)劃單列市范圍內(nèi)，跨地區(qū)經(jīng)營，其具體的征收辦法還要看所在地省、自治區(qū)、直轄市或者計(jì)劃單列市稅務(wù)機(jī)關(guān)的政策規(guī)定。

　　國稅函[2010]156號自2010年1月1日起施行，因此對建筑企業(yè)2009年度企業(yè)所得稅匯算清繳沒有影響。