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是的，只有開具農產品收購發(fā)票，才能申請扣除增值稅。按照《增值稅收入管理辦法》的規(guī)定，收購農產品的，可以減免本單位應納稅款，條件是：必須開具農產品收購發(fā)票。開票時，必須注明農產品名稱、規(guī)格、數(shù)量和金額等內容，有助于增值稅申報。 另外，也可以通過認證、報送農產品收購明細，以及認真維護好農產品收購發(fā)票等方式，加強農產品收購管理和收稅管理，以及積極申報增值稅，以獲得最大的減稅效益。 拓展： 1、增值稅減免的稅種：增值稅減免的稅種包括關稅、增值稅和船舶稅，以及按照國務院相關規(guī)定的其他稅種。 2、減免的條件：減免的條件包括按照國家規(guī)定的減免政策確定的；科研機構按照規(guī)定的條件對本單位所投資的科學技術研究開發(fā)活動；滿足國家規(guī)定的條件，可以申請減免稅款或者可以適用稅率下降的。