在稅務(wù)稽查活動中，一旦出現(xiàn)稅務(wù)稽查糾紛，納稅人的頭腦一定要冷靜，最好坐下來認(rèn)真分析一下產(chǎn)生稅務(wù)稽查糾紛的原因與主要分歧，緊緊圍繞稅收法規(guī)思考和處理稅務(wù)稽查糾紛。對于稅務(wù)稽查人員態(tài)度惡劣、粗魯，欺人太甚都應(yīng)該提出抗議，根據(jù)《國家公務(wù)員法》向有關(guān)部門提出抗議是完全可以的。納稅人自己的權(quán)利應(yīng)由納稅人自己來保護(hù)。
（一）分析稅務(wù)稽查糾紛的方法與技巧。
1.分析檢查人員有沒有越權(quán)。
《稅收征收管理法》賦予稅務(wù)稽查人員六項權(quán)利，但納稅人要留意稽查人員在稅務(wù)稽查過程中是否越權(quán)，如果越權(quán)可能會形成執(zhí)法不當(dāng)，納稅人完全可以不予理睬。稅務(wù)稽查人員擁有以下六項主要權(quán)利：①查賬權(quán)，②場地檢查權(quán)，③責(zé)成提供資料權(quán)，④詢問權(quán)，⑤在交通要道和郵電企業(yè)的查證權(quán)，⑥查核存款賬戶權(quán)。
2.分析稅務(wù)稽查人員掌握的證據(jù)是否充分。
事實上，有些稅務(wù)稽查人員在查處稅收違法案件過程中往往捕風(fēng)捉影、牽強(qiáng)附會、生拉硬扯，強(qiáng)行定案。諸如此類的問題，在目前的稅務(wù)案件中，所占的比例還不小，保守點估計，至少要占稅務(wù)稽查案件的30%以上。可以這樣說，取證不足，是目前基層稅務(wù)稽查工作的通病，許多稅務(wù)稽查人員的工作底稿取證明顯不足，財務(wù)邏輯性不強(qiáng)。此外，對有關(guān)事實尚未查清就定案的也屢見不鮮。因此，一旦發(fā)生稅務(wù)稽查糾紛，納稅人完全可以利用稽查環(huán)節(jié)中的這些弱點，進(jìn)行還擊，依法維護(hù)自身的合法權(quán)益。
3.分析稅務(wù)稽查人員的執(zhí)法程序是否合法。
稅收執(zhí)法和其他法律部門一樣，在具體的執(zhí)法過程中，要講究程序，一旦程序錯誤，即使其他方面沒有問題，最終的案件認(rèn)定也不能成立。因此納稅人要利用有關(guān)法律的這一規(guī)定，以維護(hù)自身的正當(dāng)權(quán)益。
�。�1）稅務(wù)登記環(huán)節(jié)：納稅人沒有按照稅法的規(guī)定辦理稅務(wù)登記、建賬建制、保管稅務(wù)機(jī)關(guān)要求保管的賬冊憑證、向稅務(wù)機(jī)關(guān)報送稅務(wù)機(jī)關(guān)要求報送的資料的，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)先實施教育程序，即限期改正，如果限期不改的，才能給予處罰。
（2）納稅申報期限：企業(yè)是否超出納稅期限仍未納稅。如果該納稅的，但未超出納稅期限的不能予以處罰。
�。�3）稅務(wù)檢查環(huán)節(jié)：稅收保全、稅收強(qiáng)制執(zhí)行等環(huán)節(jié)，稅務(wù)機(jī)關(guān)的做法是否正確，有無強(qiáng)制征收、強(qiáng)行處理的情況。
�。�4）稅收執(zhí)法程序：稅務(wù)機(jī)關(guān)有沒有違反執(zhí)法程序要求的做法。
4.分析稅務(wù)稽查糾紛問題的性質(zhì)。
在處理稅務(wù)稽查糾紛過程中，對于每一個納稅人而言，有一個問題必須認(rèn)真加以研究，即對所涉及的稅務(wù)稽查糾紛問題的性質(zhì)的界定，是屬于偷稅還是過失（核算錯誤）；是屬于違法還是犯罪。因為納稅人偷稅與納稅人由于核算錯誤而造成的過失，在法律上所要承擔(dān)的法律責(zé)任是不一樣的，一旦被確認(rèn)為犯罪，情況將更糟。所以，納稅人必須認(rèn)真加以辨識自身所存在的問題是屬于偷稅還是屬于過失。