新《企業(yè)所得稅法》第三十條第一款規(guī)定，開發(fā)新技術(shù)、新產(chǎn)品、新工藝發(fā)生的研究開發(fā)費用可以在計算應(yīng)納稅所得額時加計扣除。這樣，研究開發(fā)費加計扣除政策上升為《企業(yè)所得稅法》中的法律條款，體現(xiàn)了國家對該項政策的高度重視。
新《企業(yè)所得稅法實施條例》第九十五條規(guī)定，企業(yè)所得稅法第三十條第（一）項所稱研究開發(fā)費用的加計扣除，是指企業(yè)為開發(fā)新技術(shù)、新產(chǎn)品、新工藝發(fā)生的研究開發(fā)費用，未形成無形資產(chǎn)計入當(dāng)期損益的。在按照規(guī)定據(jù)實扣除的基礎(chǔ)上，按照研究開發(fā)費用的50％力H計扣除。形成無形資產(chǎn)的。按照無形資產(chǎn)成本的150％攤銷。
2008年12月，國家稅務(wù)總局發(fā)布《關(guān)于印發(fā)〈企業(yè)研究開發(fā)費用稅前扣除管理辦法（試行）〉的通知》（國稅發(fā)[2008]116號），該通知是稅務(wù)機關(guān)、企業(yè)全面貫徹落實研究開發(fā)費用稅前扣除政策嚴(yán)謹(jǐn)、具體、統(tǒng)一的政策依據(jù)和操作程序。
目前，關(guān)于研究開發(fā)費加計扣除至少有以上3個文件可以遵照執(zhí)行，但由于一些研發(fā)企業(yè)對以上文件理解得不準(zhǔn)確，不能按照要求向稅務(wù)機關(guān)提供相關(guān)備案資料，因而不能享受加計扣除的優(yōu)惠政策。所以研發(fā)企業(yè)認(rèn)真領(lǐng)會法律法規(guī)的含義，并用于指導(dǎo)和規(guī)范經(jīng)營活動及會計核算，對于企業(yè)有著重要意義。
研發(fā)活動的界定
國稅發(fā)[2008]116號文件之前的相關(guān)文件并沒有對企業(yè)研究開發(fā)活動作出明確規(guī)定，企業(yè)開發(fā)新技術(shù)、新產(chǎn)品、新工藝發(fā)生的活動都可以視為符合規(guī)定的研發(fā)活動。國稅發(fā)[2008]116號文件第三條明確了適用加計扣除的研究開發(fā)活動是指“企業(yè)為獲得科學(xué)與技術(shù)（不包括人文、社會科學(xué)）新知識，創(chuàng)造性運用科學(xué)技術(shù)新知識，或?qū)嵸|(zhì)性改進技術(shù)、工藝、產(chǎn)品（服務(wù)）而持續(xù)進行的具有明確目標(biāo)的研究開發(fā)活動”。同時，該文件第四條規(guī)定。上述研究開發(fā)活動僅限于《國家重點支持的高新技術(shù)領(lǐng)域》和《當(dāng)前優(yōu)先發(fā)展的高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化重點領(lǐng)域指南（2007年度）》所規(guī)定的項目。這樣的規(guī)定為研發(fā)費用加計扣除的適用設(shè)定了較高的門檻。
適用對象
隨著新《企業(yè)所得稅法》及實施條例的頒布和“居民企業(yè)”概念的引入，一國稅發(fā)[2008]116號文件將研發(fā)費用加計扣除的適用范圍相應(yīng)調(diào)整為“財務(wù)核算健全并能準(zhǔn)確歸集研究開發(fā)費用的居民企業(yè)”。由此可見，以下企業(yè)不能享受：
�。ㄒ唬┓蔷用衿髽I(yè)，非居民企業(yè)計算稅收的依據(jù)是收入全額，除了固定資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓可扣除凈值外，沒有可扣除項目。
�。ǘ┖硕ㄕ魇掌髽I(yè)，因為核定征收所得稅企業(yè)不能滿足財務(wù)核算健全并能準(zhǔn)確歸集研究開發(fā)費用的條件。
（三）財務(wù)核算健全但不能準(zhǔn)確歸集研究開發(fā)費用的企業(yè)。
研發(fā)開支范圍
對于允許在計算應(yīng)納稅所得額時實行加計扣除的費用支出，國稅發(fā)[2008]116號文件第四條采用了列舉法，共列舉了8項費用。與國稅發(fā)[2008] 116號文件出臺之前的文件比較，研發(fā)費用范圍總體是相類似的，細(xì)節(jié)上有差異。
值得注意的是，國稅發(fā)[2008]116號文件沒有“與研發(fā)活動直接相關(guān)的其他費用”的類似規(guī)定，而將研發(fā)費用的范圍嚴(yán)格地限定在列舉的8類費用中，具體而又明確，既有利于研發(fā)企業(yè)按照規(guī)定歸集和申報材料，又有利于稅務(wù)機關(guān)的監(jiān)管。
高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理中規(guī)定的企業(yè)研究開發(fā)費用的范圍，要比國稅發(fā)[2008]116號文件規(guī)定的研究開發(fā)費用范圍寬泛。在這種情況下，研發(fā)企業(yè)在進行高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定時，應(yīng)按照《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》（國科發(fā)火[2008]362號）的規(guī)定提供有關(guān)資料，但在申請研發(fā)費用加計扣除時，應(yīng)嚴(yán)格按照國稅發(fā)[2008]116號文件的規(guī)定提供備案資料。
研發(fā)費用的歸集與核算
目前，一些研發(fā)企業(yè)沒有按照文件規(guī)定設(shè)置研發(fā)費用明細(xì)賬，對相關(guān)費用列支不標(biāo)準(zhǔn)，不規(guī)范，導(dǎo)致主管稅務(wù)機關(guān)無法合理確定各類成本、費用支出，因而企業(yè)不能享受研發(fā)費用扣除的優(yōu)惠政策。為此，企業(yè)應(yīng)該從以下幾個方面入手，準(zhǔn)確歸集和核算研發(fā)費用。
一是企業(yè)應(yīng)當(dāng)建立健全財務(wù)制度和研發(fā)費用管理制度，企業(yè)應(yīng)按照財政部制定的會計準(zhǔn)則和會計制度，在相關(guān)科目下，設(shè)置明細(xì)科目，核算實際發(fā)生的研發(fā)費用，并按研發(fā)項目設(shè)立項目臺賬，按照國稅發(fā)[2008] 116號文件附表的規(guī)定項目，準(zhǔn)確歸集填寫年度可加計扣除的各項研究開發(fā)費用實際發(fā)生金額。
二是企業(yè)在一個納稅年度內(nèi)進行多個研發(fā)活動時，應(yīng)按照不同開發(fā)項目分別設(shè)置明細(xì)科目和項目臺賬，歸集可加計扣除的研發(fā)費用額。
三是企業(yè)未設(shè)立專門的研發(fā)機構(gòu)或企業(yè)研發(fā)機構(gòu)同時承擔(dān)生產(chǎn)經(jīng)營任務(wù)的，應(yīng)對研發(fā)費用和生產(chǎn)經(jīng)營費用分開核算，準(zhǔn)確合理地計算各項研發(fā)費用支出。
對企業(yè)共同合作開發(fā)、委托給外單位、集團公司進行集中開發(fā)的研究開發(fā)項目，國稅發(fā)[2008]116號文件也有明確的規(guī)定。
對企業(yè)共同合作開發(fā)的項目，依據(jù)國稅發(fā)[2008]116號文件第五條由合作各方就自身承擔(dān)的研發(fā)費用分別按照規(guī)定計算加計扣除額。
對企業(yè)委托給外單位進行開發(fā)的研發(fā)費用，依據(jù)國稅發(fā)[2008]116號文件第六條由委托方按照規(guī)定計算加計扣除額，受托方不得再進行加計扣除。這就避免了研發(fā)費用加計扣除在委托方和受托方中的重復(fù)計算問題。
集團公司進行集中開發(fā)的研究開發(fā)項目，依據(jù)國稅發(fā)[2008]116號文件第十五條規(guī)定，其實際發(fā)生的研究開發(fā)費，可以按照合理的分?jǐn)偡椒ㄔ谑芤婕瘓F成員公司間進行分?jǐn)偂?
及時備案所需資料
有的納稅人認(rèn)為，只要是發(fā)生的符合條件的研發(fā)費用，稅務(wù)機關(guān)都應(yīng)當(dāng)允許加計扣除，形式上的資料并不重要。這種觀點將會給企業(yè)帶來不必要的涉稅風(fēng)險，要想享受加計扣除優(yōu)惠，就必須保留和整理相關(guān)資料，這些資料主要有項目立項報告、項目費用和人員預(yù)算、董事會決議、項目合同或協(xié)議、項目效用報告等及時提交稅務(wù)機關(guān)。
政府對研發(fā)投入實行稅收優(yōu)惠政策，并且設(shè)定了一些條件和程序，體現(xiàn)了法律的嚴(yán)肅性、規(guī)范性和可執(zhí)行性。企業(yè)要享受稅收優(yōu)惠政策，必須符合條件，并按一定的程序提交相應(yīng)的證明材料，這有利于引導(dǎo)企業(yè)規(guī)范其研發(fā)活動。研發(fā)活動規(guī)范了，政府便可以獲得企業(yè)研發(fā)投入的信息，企業(yè)也可以降低研發(fā)投入的風(fēng)險，加強研發(fā)管理，提高研發(fā)效率。